El Programa 1000 horas conforma la ruta formativa del Colegio Padre Pedro Arrupe, que se desarrolla desde prekínder a cuarto año medio. Fortalece el aprendizaje, el vínculo y la construcción del proyecto de vida de cada estudiante. En cada proyecto que forma parte de este programa, están presentes íntegramente los ejes estratégicos del Proyecto Educativo Institucional: Aprendizaje, Vínculo y Proyecto de Vida.